在类固醇所产生的副作用中，首当其冲受到影响的就是我们的性腺轴，前文讲过，我们所使用的所有类固醇激素药物本质上就是外源性的性激素，而性激素在人体可以主导我们的肌肉生长作用，人体内分泌系统有三大分支系统，下丘脑-垂体-甲状腺轴；下丘脑-垂体-肾上腺轴；下丘脑-垂体-性腺轴，这三大内分泌系统各自之间有着明确的分工，同时又相互关联协同。
下丘脑-垂体-性腺轴是控制人体性激素分泌的分支。就这条轴而言，下丘脑分泌促性腺激素释放激素（GnRH），GnRH可促进垂体分泌促黄体生成素（LH）、促卵泡刺激素（FSH）和泌乳素（PRL），泌乳素作用在乳腺上，促进乳腺发育及乳汁的产生。LH和FSH作用在女性的卵巢上，促进卵巢分泌孕酮（P）和雌二醇（E2）；作用在男性的睾丸上，促进睾丸分泌睾酮（TTE）。当然女性的卵巢也会分泌少量的睾酮，男性的睾丸也会分泌少量的P和TTE。孕酮是孕早期保持妊娠继续的重要的激素，可使女性的体温升高0.3-0.5度，E2可促使女性生殖系统的发育及第二性征的出现及维持。同时E2和P协同作用在子宫内膜上，维持女性正常的月经周期。TTE是维持一个人正常的性欲必要的激素，同时可以促进骨骼和肌肉的发育，这就是为什么男性的体格要比女性宽大的原因，也是男性的性欲比女性要强的原因，因为男性体内的TTE比女性要高很多。其中血中PRL、P、E2、TTE的含量又会有一个反馈机制到达下丘脑，当血中这些激素的含量升高或降低时，下丘脑收到这个反馈信息后会调整GnRH的分泌，以期调整血清中LH、FSH、PRL的量，最终调整P、E2、TTE的含量。整个流程简单地说是这样。这个轴内任何一个部位发生功能紊乱或疾病，都会影响到人体性激素的分泌，出现一系列不同的临床病症。但远不止这么简单，其他两个内分泌系统的分支如果功能发生紊乱，也会影响到性腺轴的激素分泌，例如：甲状腺功能亢进或减低会影响女性的月经周期及排卵，也会影响男性的精子成熟及性功能。
当我们使用外源性激素以后， 我们的下丘脑HPGA感知到我们的体内的睾酮水平已经过高，便会自动停止或减少自身激素的分泌与运转，人体虽然智能，但是对于激素而言，它是分别不出外源激素与内源激素，它只会认定人体激素水平已经足够，从而停止自身激素的分泌，当我们睾酮水平超出正常生理范围后，性腺轴的所分泌Gnrh促性腺激素释放激素的量也会相应的减少甚至完全停止，此时我们体内激素的絮乱与数据的不合理便会引起一些问题，最显著的就是我们经常提到的生育问题，因为性腺轴控制了多个激素，当内分泌整个一团糟时，我们体内的精子数量会完全减少或停止，同时精子质量过差，因此便会引起使用过程中的生育问题。
除了外源性的激素对于性腺轴本身的抑制外，其他激素也会对性腺轴造成影响，例如过高的雌激素，也会对性腺轴造成严重的抑制，那么如何判断性腺轴的抑制程度呢？最简单的一个判断就是观察睾丸的大小有无缩小情况。
那么我们每次的类固醇使用对性腺轴的伤害会有那些？性腺轴最敏感的还是多次性的开关开关，被抑制后又刺激其正常分泌恢复正常，刚恢复正常以后又被抑制，如此反复性腺轴可能会出现完全脱敏，甚至引起不可逆转的伤害。，但总的而言，性腺轴还是非常坚强的，每次都能从重压之中走出阴影....只不过经过一次cycle的摧残之后，体内的内分泌需要很久才会恢复正常，在很长一段时间内，体内的内分泌都可能是非常混乱的。
